Frage:
Warum war es so schwer, das Maisgenom zu entschlüsseln?
Gabriel Fair
2011-12-24 11:52:25 UTC
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Meine erwachsenen Lehrer sagten mir, es sei unmöglich, das Maisgenom zu entschlüsseln. Aber es ist geschafft.

Warum war die Entschlüsselung des Genoms so bedeutend und was machte es so schwierig?

Wenn ich mich richtig erinnere: Es ist riesig und hat viele sich wiederholende Regionen. Es ist sehr schwierig, Wiederholungen * de novo * mit hoher Wiedergabetreue genau zu sequenzieren.
Zwei antworten:
#1
+23
Damian Kao
2011-12-24 12:48:36 UTC
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Die kurze Antwort lautet, dass das Maisgenom groß ist und eine große Anzahl von Duplikationsereignissen aufweist. Rund 80% des Genoms wiederholen sich. Es ist schwierig, Genome mit einer großen Anzahl von Duplikationen zusammenzusetzen, da unsere Sequenzierungstechnologie praktisch bestenfalls ~ 500 Basenpaare ergeben kann. Das Herausfinden der Reihenfolge von duplizierten Regionen hängt von Gerüstsequenzen oder der vergleichenden Anordnung zum Reisgenom ab.

#2
+9
chkuo
2012-01-06 00:13:34 UTC
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Warum war die Entschlüsselung des Genoms so wichtig? Weil die Entschlüsselung des Genoms ein vollständiges Bild der genetischen Ausstattung eines Organismus liefert.

Was hat es so schwierig gemacht? ? Die sich wiederholenden Sequenzen, wie sie von anderen Personen erwähnt werden, sind ein Hauptproblem. Stellen Sie sich vor, Sie versuchen, ein großes Puzzle mit Millionen von Teilen zu lösen. Jedes Stück repräsentiert eine Sequenzierung, die wir aus dem Experiment erhalten. Wenn es sich wiederholende Sequenzen im Genom gibt, würden die Teile, die diese Regionen darstellen, im Grunde sehr ähnlich (oder sogar völlig identisch) aussehen. Zweifellos würde dies das Rätsel sehr schwer zu beenden machen. Um eine Skala zu erhalten, beträgt das Maisgenom ~ 2,3 Milliarden Basenpaare und jede Sequenzierung lautet <1.000 Basenpaare.



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