Frage:
Phylogenetik und der Baum des Lebens
AliceD
2014-12-29 18:47:07 UTC
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Soweit ich weiß, wird die Evolution heutzutage ziemlich genau durch phylogenetische Bäume analysiert, dh durch Cladogramme. Diese werden unter Verwendung der verfügbaren Aufzeichnungen und unter Verwendung einiger Schlüsselstrukturen konstruiert und abgeleitet, ob Arten sie erworben haben oder verloren haben, wodurch ein Knoten erzeugt wird. Bei diesem Ansatz ist die Chronologie von größter Bedeutung, die chronologische Zeit jedoch nicht. Daher sind Cladogramme keine "darwinistischen" Evolutionsbäume, da letztere auf chronologischer Zeit basieren.

Ich kann mir jedoch nicht helfen, wenn ich ein Cladogramm analysiere und die Akkumulation verschiedener Knoten interpretiere entlang eines Astes als Bewegung durch die Zeit. Geht es in der Evolution nicht nur um Zeit? Auf die Gefahr hin, mich in eine "Dies ist eine hauptsächlich meinungsbasierte Frage" zu stürzen:

Ist es nicht nur so, dass entlang eines bestimmten Zweigs jeder aufeinanderfolgende Knoten Zeit gebraucht hat, um sich zu entwickeln stark>? Wäre es nicht plausibel, eine bestimmte ' Standard-Evolutionszeiteinheit (eine SETU, wenn Sie möchten) zu bestimmen und zuzuweisen, die die durchschnittliche Zeit darstellt, die ein Organismus benötigt, um ein bestimmtes Merkmal zu verlieren oder zu erwerben, wodurch jeder Knoten als Zeit zu interpretieren ? Natürlich wäre die SETU eine grobe Schätzung, könnte aber möglicherweise den darwinistischen Blick auf die moderne Evolution wiederbeleben.

Zwei antworten:
Remi.b
2014-12-29 20:50:21 UTC
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Beginnen wir mit einem kurzen Kommentar. Sie sagen, die [..] Evolution wird heutzutage ziemlich genau durch phylogenetische Bäume [..] analysiert. Viele Evolutionsbiologen verwenden in großem Umfang phylogenetische Methoden, aber ein großer Teil der Evolutionsbiologen (die meisten davon würde ich sagen) arbeitet nicht direkt mit phylogenetischen Methoden.


Ich bin nicht sicher, ob ich Ihre Frage verstehe Ich hoffe jedoch, dass das Folgende Ihnen helfen kann, das Problem zu verstehen oder Ihre Frage zu bearbeiten. Beachten Sie, dass ich KEIN Phylogenetiker bin (nicht sicher, ob dieses Wort existiert).

Was ist die Definition von "Knoten" in der Phylogenetik?

Ich denke, Ihre Definition eines -Knotens kann ungewöhnlich sein. In der Phylogenie ist ein Knoten der letzte gemeinsame Vorfahr, den zwei Schwesterlinien gemeinsam haben.

Zeit in einem phylogenetischen Baum

Auch wenn Sie sich a ansehen Der phylogenetische Baum, die Achse, entlang der sich die Linien diversifizieren, repräsentiert die Zeit (Echtzeit in Jahren). Nun verwenden wir verschiedene Methoden, um diese Echtzeit abzuschätzen, beispielsweise die Rate der neutralen Substitutionen. Vielleicht möchten Sie etwas über molekulare Uhr

lesen, für deren Entwicklung jeder nachfolgende Knoten Zeit benötigt hat?

Ich bin mir nicht sicher, was du meinst hier "entwickeln". Entwickeln bedeutet normalerweise den Prozess, durch den sich ein bestimmtes Individuum / ein bestimmter Organismus während seines Lebens phänotypisch verändert. Siehe Entwicklungsbiologie.

durchschnittliche Zeit, die ein Organismus benötigt, um ein bestimmtes Merkmal zu verlieren oder zu erwerben

Auch hier bin ich mir nicht sicher, ob Sie hier über Entwicklung oder Evolution sprechen, wenn Sie über "irgendeinen Organismus" und nicht über "irgendeine Bevölkerung" sprechen. In jedem Fall ist eine durchschnittliche Zeit, die eine Bevölkerung benötigt, um ein bestimmtes beliebiges Merkmal zu erwerben, ein Konzept, das 1) nur für diskrete Merkmale gilt, 2) das stark von der Art des Merkmals abhängt, das Sie berücksichtigen möchten, 3) das variiert Vieles von einem bestimmten Merkmal zum anderen und 4) hängt stark davon ab, wann Sie den Ausgangspunkt des Evolutionsprozesses für die Schaffung des angegebenen Merkmals betrachten. Daher ist dies nicht sehr sinnvoll.

Derzeit verwendete "Standard-Evolutionszeiteinheit"

Sie können jedoch ein ähnliches Konzept für quantitative Merkmale verwenden. Der Darwin (d) ist eine Einheit des evolutionären Wandels (erfunden von Haldane und benannt nach C. Darwin). Es ist definiert als das E-Fold (e≈2.7) im Mittel des individuellen Merkmals in einer Bevölkerung über Millionen von Jahren.

In ähnlicher Weise ist das Haldane eine Einheit des evolutionären Wandels (ich weiß nicht) Wer hat es erfunden und es ist offensichtlich nach JBS Haldane benannt) und entspricht der Anzahl der Standardabweichungen (der Verteilung der einzelnen Merkmale in der Bevölkerung), die sich im Mittelwert der einzelnen Merkmale in einer Bevölkerung pro Generation ändern. Die Haldane-Einheit ist daher abhängig vom Selektionsdruck, der additiven und nichtadditiven genetischen Varianz und der Umweltvarianz (daher der Erblichkeit) und dem Mutationsdruck

"... Phylogenetiker (nicht sicher, ob dieses Wort existiert)." Ich werde sagen, dass es das tut und nur jemanden meint, der Phylogenetik praktiziert. Ein besseres Wort könnte "Taxonom" sein.
Vielen Dank tel für Ihre Zustimmung! Chris, lass uns wissen, ob die Antwort (en) deine Frage beantworten und beantworten.
Das ist auf jeden Fall sehr hilfreich. Und es beantwortet so ziemlich meine Frage (n), wie ich Cladogramme interpretieren soll / kann, ihre Verwendungshäufigkeit und die Bedeutung von "Zeit" in einem Cladogramm. Cladogramme sind sehr abstrakt, aber sehr hilfreich, und diese Antwort verdeutlicht viel über sie. Ich muss sagen, dass meine Wahrnehmung eines 'Knotens' wahrscheinlich falsch war und ich meine Frage umformulieren könnte, um sie angemessener zu machen, aber Ihre Antwort ist großartig und ich lasse meine Frage so wie sie ist, wenn das für alle in Ordnung ist :)
tel
2014-12-29 22:24:29 UTC
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So etwas wie das, was Sie beschreiben, existiert und wird als molekulare Uhr bezeichnet. Die Änderungsrate bestimmter Gene und nichtkodierender Sequenzen wurde mit anderen Belegen (Fossilienbestand usw.) so korreliert, dass Sie absolut abschätzen können, wie lange ein bestimmter Satz von Mutationen auf natürliche Weise dauern würde

Beachten Sie, dass nur bestimmte Gene die erforderliche Eigenschaft haben, Mutationen zeitlich mehr oder weniger konstant zu akkumulieren. Die meisten Gene akkumulieren Mutationen auf stochastischere Weise.



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