Mir ist bekannt, dass jedes Enzym eine bestimmte Menge an Fehlprodukten erzeugt. Dies ist beispielsweise für die DNA-Polymerase gut dokumentiert.
Ich interessiere mich für Enzyme, die an biochemischen Prozessen beteiligt sind, beispielsweise Methytransferase , Oxidoreduktase, Carboxylase und so weiter. Ich habe nach einer Referenz gesucht, die die Fehlerrate oder die Menge an Fehlprodukten für eines dieser Enzyme angeben könnte, aber ich war nicht erfolgreich.
Kennt jemand eine Referenz? Melden Sie die Fehlerrate oder andere Informationen über das durch diese Enzyme erzeugte Fehlprodukt?
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Ich werde versuchen, meine Frage etwas besser zu klären. Nehmen wir an, wir betrachten ein Enzym, das einem Molekül eine Methylgruppe hinzufügt. Wir können beispielsweise Propionsäure wählen. Theoretisch würde das richtige Produkt aus der Zugabe eines Methyls zum C3 stammen. Für die biochemische Studie wissen wir, dass die Aktivierungsenergie durch ein Enzym verringert wird, indem beispielsweise die Moleküle so ausgerichtet werden, dass sie mit dem zweiten Molekül reagieren. Wenn das betreffende Enzym das Molekül nicht richtig ausrichten kann, besteht daher eine gewisse Wahrscheinlichkeit, dass es zu einem Fehlprodukt kommt. Beispielsweise könnte die Methylgruppe zu C2 und nicht zu C3 hinzugefügt werden. Jetzt. Die Wahrscheinlichkeit für diesen Prozess ist recht gering, kann aber nicht ausgeschlossen werden. Meine Frage ist, ob über diese Art von Fehlerraten bei den verschiedenen Arten von Enzymen etwas bekannt ist.
Ich hoffe, dass dies der Fall ist Dinge etwas klarer
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Betrachten wir die folgende Vorstellung, die von hier
In B sehen Sie die Wechselwirkung des aktiven Zentrums des Enzyms mit einem Substrat (zum Beispiel spielt es keine Rolle, ob es sich um das reale Substrat oder einen Inhibitor handelt). Ich würde sagen, dass unter allen möglichen Wechselwirkungen, die dieses aktive Zentrum mit Substraten herstellen kann, einige viel wahrscheinlicher sind als andere. Ein hypothetisches Diagramm könnte unter Berücksichtigung der freien Energie des komplexen Enzymsubstrats erstellt werden. Je höher die freie Energie, desto geringer die Stabilität. Daher haben wir unter allen möglichen Enzym-Substrat-Kombinationen nur wenige Möglichkeiten, die eine niedrige freie Energie aufweisen. Zuerst werden wir das "richtige" Substrat finden, dann werden wir eventuelle Konkurrenten und andere Moleküle finden, die ähnliche chemische Eigenschaften wie das Substrat haben. Obwohl mit geringer Wahrscheinlichkeit diese Wechselwirkung, Enzym-Konkurrenten, auftreten wird. Dies könnte zur Bildung eines "unerwünschten Produkts" führen, das ich in meiner Frage als "Fehlprodukt" bezeichnet habe.
Ich bin am Lesen interessiert Einige Artikel, die dieses Phänomen betrachten und auch seine Rate quantifizieren. Ich bin auch neugierig, ob dieses Phänomen mit unterschiedlichen Raten in unterschiedlichen Enzymen auftreten kann.